Οι θεματικές ενότητες του μαθήματος «Βιοχημικές Διεργασίες» είναι οι κάτωθι:
- Αρχές μικροβιολογίας, βιοχημείας και γενετικής
 
	- Κινητική ενζυμικών δράσεων, Σύνθετες ενζυμικές δράσεις, Επίδραση περιβαλλοντικών παραγόντων στην κινητική των ενζυμικών δράσεων
 
	- Συστήματα ακινητοποιημένων ενζύμων
 
	- Κινητικά μοντέλα κυτταρικής ανάπτυξης. Κινητική παραγωγής μεταβολικών προϊόντων. Ισοζύγια μάζας σε βιοαντιδραστήρες κυττάρων. Επίδραση περιβαλλοντικών παραγόντων στην κινητική της κυτταρικής ανάπτυξης
 
	- Συστήματα βιοαντιδραστήρων - Βιοαντιδραστήρες διαλείποντος έργου
 
	- Συστήματα βιοαντιδραστήρων - Βιοαντιδραστήρες συνεχούς ροής και ημιδιαλείποντος έργου
 
	- Συστήματα βιοαντιδραστήρων - Βιοαντιδραστήρες εμβολικής ροής
 
	- Μεταφορά Ο2 σε Καλλιέργειες Κυττάρων. Διαλυτότητα του Ο2. Παράγοντες που Επηρεάζουν τη Μεταφορά Ο2 σε Ζυμωτήρες. Απαίτηση των Κυττάρων σε Ο2. Προσδιορισμός kLα
 
	- Διατάξεις Μηχανικής Ανάδευσης. Πρότυπα και Μηχανισμοί Ανάμειξης. Προσδιορισμός Αποτελεσματικότητας της Ανάμειξης. Ενεργειακές Απαιτήσεις της Ανάδευσης
 
	- Θερμική Καταστροφή Μικροοργανισμών. Αποστείρωση Διαλείποντος και Συνεχούς έργου. Αποστείρωση με Διήθηση. Αποστείρωση Αέριων Ρευμάτων
 
	- Σχεδιασμός βιοαντιδραστήρων για μικροβιακή ανάπτυξη, απομάκρυνση θρεπτικών συστατικών και παραγωγή μεταβολικών προϊόντων
 
	- Ετερογενείς Αντιδράσεις και Βιοτεχνολογικές Διεργασίες. Στερεοί Βιοκαταλύτες. Περιοριστικά Φαινόμενα στην Κύρια Φάση του Ρευστού. Ακινητοποιημένα Ένζυμα. Αντίδραση στο Εσωτερικό Στερεού Βιοκαταλύτη. Άμβλυνση Περιορισμών λόγω Μεταφοράς Μάζας
 
	- Βελτιστοποίηση λειτουργίας βιοαντιδραστήρων, Διαχωρισμοί διεργασιών.