1. Εισαγωγικές έννοιες - Μακρομόρια μικροοργανισμών.
2. Μικροσκοπία και κυτταρική μορφολογία. Κυτταρικές μεμβράνες και κυτταρικά τοιχώματα.
3. Μετακίνηση μικροοργανισμών. Δομές επιφάνειας και έγκλειστα προκαρυωτών.
4. Θρέψη και εργαστηριακές καλλιέργειες.
5. Μεταβολισμός μικροοργανισμών.
6. Θεωρία και πρακτική της μικροβιακής αύξησης. Περιβαλλοντικές επιδράσεις στη μικροβιακή αύξηση.
7. Επισκόπηση των γονιδίων και της γονιδιακής έκφρασης. Σύνθεση και επεξεργασία του RNA.
8. Ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης.
9. Μικροβιακή εξέλιξη και συστηματική.
10. Αρχές Μικροβιακής Οικολογίας.
11. Χαρακτηρισμός μικροβιακών πληθυσμών και κοινοτήτων με μεθόδους κλασικής μικροβιολογίας και μοριακής μικροβιακής οικολογίας.
12. Mηχανισμοί μεταφοράς και ανταλλαγής γενετικού υλικού. Mεταθετά στοιχεία. Πλασμίδια.
13. Ιοί και ιόσωμα, ιικός πολλαπλασιασμός, ιική ποικιλότητα.