• Εισαγωγή: Το περιβάλλον, Ρύπανση περιβάλλοντος, Τα οικοσυστήματα, παραγωγοί και καταναλωτές, Ροή της ενέργειας στα οικοσυστήματα, τροφικές αλυσίδες και τροφικά επίπεδα, ενέργεια και βιομάζα, Βιοσυσυσσώρευση-βιομεγένθυση
• Καπνομίχλες
• Όξινη βροχή, Επιπτώσεις της όξινης βροχής στο περιβάλλον
• Οι βιογεωχημικοί κύκλοι: Κύκλος του νερού, Κύκλος του υδρογόνου, Κύκλος του άνθρακα, Κύκλος του οξυγόνου, Κύκλος του αζώτου, Κύκλος του θείου, Κύκλος του φωσφόρου, Κύκλος του σιδήρου
• Υδρόσφαιρα: Το νερό και οι μοναδικές του ιδιότητες, Θάλασσες – Ωκεανοί, Λίμνες, Πόσιμο νερό, Boxmodels και υπόθεση σταθερής κατάστασης
• Χημεία φυσικών νερών, Ρύπανση νερών, Έκφραση συγκέντρωσης χημικών ουσιών σε ppm, ppb, Γραμμομοριακά κλάσματα, Εκατοστιαία περιεκτικότητα, Χρήση των αποτελεσμάτων % περιεκτικότητας της στοιχειακής ανάλυσης μιας χημικής ουσίας, για την εύρεση του εμπειρικού της τύπου, Αρχές ισοσταθμίσεως της μάζας και ηλεκτρικής ουδετερότητας, Χημικό δυναμικό, Ενεργότητα, (ή τάση διαφυγής όταν αφορά αέρια), Νόμος Henry και υπολογισμός ενεργότητας αερίων διαλυμένων στο νερό
• Το pH των φυσικών νερών, Η ισορροπία ανθρακικών, Κοινά ασθενή οξέα φυσικών νερών, Βασικά ισχυρά οξέα φυσικών νερών,Η ρυθμιστική ικανότητα των φυσικών νερών. Υδατικά σύμπλοκα
• Αντιδράσεις οξειδοαναγωγής σε φυσικά συστήματα, Η εξίσωση Nernst και το Eh, Διαγράμματα οξειδοαναγωγής (Eh-pH), Η κλίμακα pe, Ο ρόλος των μικροοργανισμών στις οξειδοαναγωγικές αντιδράσεις, Οξειδοαναγωγική ρύθμιση σε φυσικά συστήματα, Κατάταξη οξειδοαναγωγικών περιβαλλόντων, Όξινη απορροή μεταλλείων
• Το έδαφος, Ο στερεός φλοιός της γης, Η εδαφική υφή και τα χαρακτηριστικά του εδάφους, Η οργανική ύλη του εδάφους
• Βαρέα μέταλλα-Τοξικά στοιχεία: Εισαγωγή, Υδράργυρος, Αρσενικό, Μόλυβδος, Κάδμιο, Χρώμιο, Σελήνιο, Ταξινόμηση επικίνδυνων ουσιών, Τοξικότητα και σχετικοί ορισμοί, Παράγοντες που επηρεάζουν την τοξικότητα των χημικών ουσιών, Εκτίμηση κινδύνου για την ανθρώπινη υγεία
• Οργανικές ενώσεις: Χλωριωμένοι αλειφατικοί υδρογονάνθρακες, Φαινόλες-Χλωροφαινόλες, Χλωριωμένες αρωματικές ενώσεις, Πολυχλωριωμένες δεβενζο-π-διοξίνες και διβενζοφουράνια, Παρασιτοκτόνα, Πολυκυκλικοί αρωματικοί υδρογονάνθρακες (ΡΑΗ), Χρώματα βαφής, Υδρογονάνθρακες πετρελαίου, Απορρυπαντικά, Μελέτη περιβαλλοντικής συμπεριφοράς οργανικών ενώσεων
• Ραδιενέργεια: Εισαγωγή, Βιολογικές επιπτώσεις της ραδιενέργειας, Πυρηνικοί σταθμοί παραγωγής ηλεκτρικής ενέργειας
• Περιβαλλοντική ορυκτολογία: Ορισμός ορυκτού, Κρυσταλλοχημεία. Αργιλικά ορυκτά και ιδιότητες ιοντοανταλλαγής, Ορυκτά αμιάντου